【核黄素的作用】附着在蛋白质颗粒表面，蛋白质颗粒变成椭圆形(掩盖了蛋白质本身的形状)，【核黄素的作用】蛋白质表面带负电(掩盖了蛋白质本身的解离和带电行为)，【核黄素的作用】使得电泳时只有分子量在起作用。

1溴化乙锭是一种高度敏感的荧光染色剂，【核黄素的作用】用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的DNA。溴化乙锭可以嵌入碱基分子，导致错配。很多人认为溴化乙锭是强诱变剂，致癌性高。

溴化乙锭由标准紫外光透射仪激发，发出橙红色信号，可通过负片或带CCD成像头的凝胶成像处理系统拍摄。【核黄素的作用】溴化乙锭含有一个三环平面基团，可以嵌入DNA堆叠碱基之间。【核黄素的作用】它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。

在高离子强度的饱和溶液中，【核黄素的作用】大约每2.5个碱基插入一个溴化乙锭分子。染料分子插入时，其平面基团垂直于螺旋轴，通过范德华力与上下碱基相互作用。该基团的固定位置及其与碱基的紧密接近导致了与DNA结合的染料的荧光，其荧光产率高于游离溶液中的染料。

DNA吸收254nm的紫外辐射并传递给染料【核黄素的作用】，而结合的染料本身吸收302nm和366nm的光辐射。在这两种情况下，吸收的能量在可见光谱的红橙色区域以590纳米重新发射。【核黄素的作用】由于溴化乙锭-DNA复合物的荧光产量比不结合DNA的染料高20-30倍，当凝胶含有游离溴化乙锭(0.5微克/毫升)时，可以检测到小到10微克的DNA条带。