【限制性内切酶】端粒酶主要分为三大类。

第一类端粒酶可以识别特异性核苷酸的顺序，【限制性内切酶】62616964757 a 686964616 Fe 4b 893 e 5b 19e 3133333738662用识别点附近的几个核苷酸切断DNA分子中的双链，但切断的核苷酸这种限制性内切酶对DNA重组技术和基因工程不太有用，【限制性内切酶】不能用于DNA结构和克隆基因的分析。

这种酶有EcoB、EcoK等。

第二类内切酶识别特异性核苷酸的顺序，【限制性内切酶】可以将其切断双链置于其顺序内的固定定位。因为这种限制性酶的识别和切断的核苷酸都是特异性的。

因此，总是能得到相同核苷酸序列的DNA片段，【限制性内切酶】构建来自不同基因组的DNA片段，形成异DNA分子。因此，这种限制性内切酶是DNA重组技术中最常用的工具酶之一。该酶识别的特异核苷酸的顺序最常见的是4个或6个核苷酸，少数还识别5个核苷酸和7个、9个、10个、11个核苷酸。

如果识别位置随机分布在DNA分子中，那么识别四个核苷酸的限制性酶每隔46(4096)个就有接点。【限制性内切酶】人的单倍体基因组估计为3199核苷酸，识别4个核苷酸的限制酶的接点约为(3199/2.5102)107个接点，即可以用该酶切割成107个片段，识别6个核苷酸的限制酶也是(3109)第二类端粒酶的识别顺序是回文对称顺序，有中心对称轴，【限制性内切酶】从此轴向两个方向“阅读”是完全相同的。

切断这种酶有两种方法。一个交替切断的结果形成两条单链末端，该末端的核苷酸顺序互补，可以形成氢键，因此称为粘性末端。例如，EcoRI的识别顺序如下。

|5’……GAA|TTC

实线的切割头表示在双链上交替切割的位置，切割后生成5’【限制性内切酶】……g和aa TTC……3’、3’……CTT AA和g……5’两个DNA片段，各有一个单链末端，两个单链互补，可以通过形成。另一个是在同一位置切断双链，生成平头末端。例如Hae的识别位置：

5’……GGCC……3’……CCGG……’在箭头指示的地方切断，【限制性内切酶】生成的两个DNA片段如下。

5’……GGCC……3’和3’……CCGG……5’有两种限制酶的识别核苷酸的顺序和切断位置相同的情况，当识别顺序中有甲基化的核苷酸时，可以切断一种限制酶。另一个不能切断。

例如HPAii和Msp的识别顺序都是5’……CCGG……3’，其中如果有5’-甲基胞嘧啶，只有HPAii可以切割。【限制性内切酶】这些具有相同接点的酶被称为同一酶或异源同工酶(isoschizomer)。第三类端粒酶也有特异的识别顺序，但不是对称的回文顺序。

把切断双链放在识别顺序旁边的几个核苷酸对的固定定位上。【限制性内切酶】但是，这些核苷酸对是任意的。因此，这种限制性内切酶切断后产生的一定长度的DNA片段具有各种单链末端。

这对克隆基因和克隆DNA片段没有什么帮助。